中心分别与南京大学、华东师范大学长期合作进行农药、医药及中间体的开发；与中国药科大学进行新型除草剂PTA的合作开发；和甘肃河西学院合作进行氟噻草胺的开发，在研项目申报了“取代苯基偶联的1,3,4-噻（噁）二唑衍生物制备及其作为除草剂”和“一种苯磺酰内脲产品及制备方法”的中国发明专利，与常州南京大学高新技术研究院合作设立南大常隆创新药物实验室。